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  • En responsabilité dans le domaine des Ressources Humaines (spécificité Public) depuis maintenant pratiquement 26 ans
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17 octobre 2026 6 17 /10 /octobre /2026 14:26

Veille juridique, statutaire, managériale et institutionnelle — Fonction publique territoriale par www.NAUDRH.COM

La veille du DRH territorial

Édition du samedi 17 octobre 2026 — Le congé de longue maladie et le congé de longue durée : régime, durées et procédure

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1. Textes législatifs et réglementaires

Le congé de longue maladie : un congé de trois ans pour affection grave et prolongée

Sources : articles L. 822-6 à L. 822-11 du code général de la fonction publique ; décret n° 87-602 du 30 juillet 1987 ; arrêté du 14 mars 1986 — le cadre du congé de longue maladie

Synthèse opérationnelle. Le congé de longue maladie, dont la gestion est à la fois technique et sensible, étant un dispositif central de la protection statutaire des agents, il est utile de consacrer un point d'ensemble à ce congé. Le congé de longue maladie, désigné par le sigle CLM, est le congé accordé au fonctionnaire atteint d'une maladie qui le rend inapte à exercer ses fonctions, qui rend nécessaires un traitement et des soins prolongés, et qui présente un caractère invalidant et de gravité confirmée. Son cadre figure aux articles du code général de la fonction publique, précisés par le décret du 30 juillet 1987 et l'arrêté du 14 mars 1986. Ce congé est, pour l'essentiel, réservé aux fonctionnaires relevant du régime spécial, c'est-à-dire affiliés à la caisse nationale de retraites des agents des collectivités locales ; les agents contractuels relèvent, quant à eux, du congé de grave maladie, au régime distinct. La durée du congé de longue maladie est de trois ans au maximum : un an à plein traitement, puis deux ans à demi-traitement. La maîtrise de ce cadre est essentielle. Pour les collectivités, maîtriser le cadre du congé de longue maladie, en connaître les conditions et la durée, et l'accorder dans les règles sont des éléments d'une gestion rigoureuse, ce dispositif étant appréhendé ici sous l'angle de la procédure et non de situations individuelles.

Point d'alerte DRH. Le congé de longue maladie (CLM) est accordé au fonctionnaire atteint d'une maladie le rendant inapte, nécessitant un traitement et des soins prolongés, et présentant un caractère invalidant et de gravité confirmée (articles L. 822-6 à L. 822-11 du code général de la fonction publique, décret n° 87-602 du 30 juillet 1987, arrêté du 14 mars 1986). Il est réservé pour l'essentiel aux fonctionnaires du régime spécial (affiliés à la caisse nationale de retraites des agents des collectivités locales) ; les contractuels relèvent du congé de grave maladie, distinct. Durée maximale : trois ans, dont un an à plein traitement puis deux ans à demi-traitement.

Impact RH : Orange Urgence : Orange

Ce que le DRH doit faire lundi matin : maîtriser le cadre du congé de longue maladie (articles L. 822-6 à L. 822-11 du code général de la fonction publique, décret n° 87-602, arrêté du 14 mars 1986 : maladie invalidante de gravité confirmée nécessitant des soins prolongés ; durée de trois ans, un an à plein traitement puis deux ans à demi-traitement ; contractuels relevant du congé de grave maladie distinct).

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Le congé de longue durée : cinq ans pour cinq groupes d'affections déterminés

Sources : articles L. 822-12 à L. 822-17 du code général de la fonction publique ; articles 20 à 32 du décret n° 87-602 du 30 juillet 1987 — le cadre du congé de longue durée

Synthèse opérationnelle. Le congé de longue durée se distingue du congé de longue maladie par son champ et sa durée, distinctions qu'il importe de connaître précisément. Le congé de longue durée, désigné par le sigle CLD, est réservé au fonctionnaire affilié à la caisse nationale de retraites des agents des collectivités locales, atteint de l'une des cinq catégories d'affections limitativement énumérées par les textes, à savoir la tuberculose, les affections cancéreuses, la maladie mentale, la poliomyélite, et le déficit immunitaire grave et acquis, et qui se trouve dans l'impossibilité d'exercer ses fonctions. Sa durée est supérieure à celle du congé de longue maladie : elle est de cinq ans au maximum, dont trois ans à plein traitement, puis deux ans à demi-traitement. Il importe de souligner que, lorsque l'affection a été contractée dans l'exercice des fonctions, la durée est portée à huit ans, dont cinq ans à plein traitement, les règles d'imputabilité au service relevant par ailleurs d'un régime propre. Le congé de longue durée n'est, en principe, accordé qu'après épuisement de la période à plein traitement du congé de longue maladie, au titre de la même affection. La connaissance de ce cadre est essentielle. Pour les collectivités, connaître le cadre du congé de longue durée, le distinguer du congé de longue maladie, et l'appliquer sont des éléments d'une gestion rigoureuse.

Point d'alerte DRH. Le congé de longue durée (CLD) est réservé au fonctionnaire affilié à la caisse nationale de retraites des agents des collectivités locales, atteint de l'une des cinq catégories d'affections limitativement énumérées (tuberculose, affections cancéreuses, maladie mentale, poliomyélite, déficit immunitaire grave et acquis), dans l'impossibilité d'exercer (articles L. 822-12 à L. 822-17 du code général de la fonction publique). Durée maximale : cinq ans, dont trois à plein traitement puis deux à demi-traitement, portée à huit ans (cinq à plein traitement) si l'affection a été contractée dans l'exercice des fonctions. Il n'est en principe accordé qu'après épuisement du plein traitement du congé de longue maladie pour la même affection.

Impact RH : Orange Urgence : Orange

Ce que le DRH doit faire lundi matin : connaître le cadre du congé de longue durée (articles L. 822-12 à L. 822-17 du code général de la fonction publique : cinq groupes d'affections limitativement énumérés, durée de cinq ans dont trois à plein traitement, huit ans si affection contractée dans l'exercice des fonctions), et le distinguer du congé de longue maladie.

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2. Jurisprudence statutaire

L'articulation des congés de maladie et le droit d'option entre longue maladie et longue durée

Sources : articles L. 822-6 et suivants du code général de la fonction publique ; décret n° 87-602 du 30 juillet 1987 — l'articulation du congé de maladie ordinaire, du congé de longue maladie et du congé de longue durée

Synthèse opérationnelle. Les différents congés de maladie s'articulent selon des règles de passage et d'option qu'il importe de maîtriser, car elles déterminent les droits de l'agent et peuvent être source de difficultés. Le congé de maladie ordinaire, d'une durée maximale d'un an, constitue le premier niveau. Lorsque la maladie répond aux conditions du congé de longue maladie, l'agent peut être placé dans ce congé, le cas échéant de manière rétroactive au regard de la première constatation de la maladie. Le point le plus délicat concerne l'articulation entre le congé de longue maladie et le congé de longue durée, pour les affections relevant des cinq groupes. À l'issue de la première année de congé de longue maladie, c'est-à-dire de la période à plein traitement, l'agent dispose d'un droit d'option : il peut choisir, de manière irrévocable, soit de basculer en congé de longue durée, soit de demeurer en congé de longue maladie à demi-traitement. Ce choix, aux conséquences importantes sur la durée des droits et sur le traitement, mérite d'être éclairé. Il importe de souligner le caractère irrévocable de cette option. La maîtrise de cette articulation est essentielle. Pour les collectivités, maîtriser l'articulation des congés de maladie, informer l'agent de son droit d'option et de son caractère irrévocable, et appliquer correctement ces règles sont des éléments d'une gestion rigoureuse.

Point d'alerte DRH. Le congé de maladie ordinaire (un an maximum) est le premier niveau. Si la maladie répond aux conditions, l'agent peut être placé en congé de longue maladie, le cas échéant rétroactivement au regard de la première constatation. Point délicat : à l'issue de la première année de congé de longue maladie (période à plein traitement), pour une affection relevant des cinq groupes, l'agent dispose d'un droit d'option IRRÉVOCABLE : basculer en congé de longue durée, ou demeurer en congé de longue maladie à demi-traitement. Ce choix, aux conséquences importantes sur la durée des droits et le traitement, doit être éclairé.

Impact RH : Orange Urgence : Orange

Ce que le DRH doit faire lundi matin : maîtriser l'articulation des congés de maladie (congé de maladie ordinaire d'un an, passage en congé de longue maladie, droit d'option irrévocable à l'issue de la première année de congé de longue maladie entre le basculement en congé de longue durée et le maintien en congé de longue maladie à demi-traitement), et informer l'agent de ce choix et de ses conséquences.

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3. Rémunération, carrière et temps de travail

Les effets sur le traitement et la carrière : plein traitement, demi-traitement et droits maintenus

Sources : articles L. 822-6 et suivants du code général de la fonction publique ; décret n° 87-602 du 30 juillet 1987 — les effets des congés de longue maladie et de longue durée sur la rémunération et la carrière

Synthèse opérationnelle. Les congés de longue maladie et de longue durée produisent des effets précis sur la rémunération et la carrière, qu'il importe de connaître pour une gestion correcte de la paie et des droits. S'agissant de la rémunération, l'agent perçoit, pendant la période à plein traitement, l'intégralité de son traitement, puis, pendant la période à demi-traitement, la moitié de celui-ci. Il importe de souligner plusieurs points. Le supplément familial de traitement et l'indemnité de résidence sont maintenus en intégralité, y compris pendant la période à demi-traitement. Le sort du régime indemnitaire pendant ces congés dépend des règles fixées par la délibération de la collectivité, qui peut en prévoir le maintien ou la suspension selon les cas. S'agissant de la carrière, la période passée en congé de longue maladie ou de longue durée est prise en compte, dans les conditions prévues, pour l'avancement et pour la retraite, de sorte que ces congés n'emportent pas, par principe, de perte de droits à ces titres. Il importe de gérer ces éléments avec rigueur. Pour les collectivités, appliquer correctement les règles de traitement pendant les congés de longue maladie et de longue durée, maintenir le supplément familial, et préserver les droits à l'avancement et à la retraite sont des éléments d'une gestion rigoureuse.

Point d'alerte DRH. L'agent perçoit l'intégralité du traitement pendant la période à plein traitement, puis la moitié pendant la période à demi-traitement. Le supplément familial de traitement et l'indemnité de résidence sont maintenus intégralement, y compris à demi-traitement. Le sort du régime indemnitaire dépend de la délibération de la collectivité, qui peut en prévoir le maintien ou la suspension. La période de congé de longue maladie ou de longue durée est prise en compte, dans les conditions prévues, pour l'avancement et la retraite : ces congés n'emportent pas, par principe, de perte de droits à ces titres.

Impact RH : Orange Urgence : Vert

Ce que le DRH doit faire lundi matin : appliquer correctement les règles de rémunération pendant les congés de longue maladie et de longue durée (plein puis demi-traitement, maintien intégral du supplément familial et de l'indemnité de résidence, sort du régime indemnitaire selon la délibération), et préserver les droits à l'avancement et à la retraite.

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4. Santé au travail, protection sociale et absentéisme

Le rôle du conseil médical et le contrôle médical

Sources : décret n° 2022-350 du 11 mars 2022 ; décret n° 87-602 du 30 juillet 1987 — le rôle du conseil médical dans les congés de longue maladie et de longue durée

Synthèse opérationnelle. L'octroi et le suivi des congés de longue maladie et de longue durée reposent sur l'intervention d'une instance médicale, le conseil médical, dont il importe de connaître le rôle et les modalités de saisine. Le conseil médical, issu de la fusion des anciens comités médicaux et commissions de réforme, intervient, dans sa formation restreinte, en matière de congés de longue maladie et de longue durée. Sa consultation est requise à plusieurs étapes : pour l'octroi de la première période du congé, pour le passage au demi-traitement, pour l'octroi de la dernière période, ainsi que pour la réintégration à l'issue des droits. Le conseil médical rend un avis, qui éclaire la décision de l'autorité territoriale, laquelle demeure compétente pour statuer et n'est pas liée par cet avis. Au-delà du conseil médical, un contrôle médical s'exerce : l'agent en congé peut être soumis à des visites de contrôle par un médecin agréé, notamment, s'agissant du congé de longue durée, au moins une fois par an après le passage au demi-traitement. Il importe de souligner que le refus de l'agent de se soumettre à un contrôle peut entraîner l'interruption du versement de sa rémunération. La connaissance de ces règles est essentielle. Pour les collectivités, saisir le conseil médical aux étapes requises, organiser le contrôle médical, et en tirer les conséquences sont des éléments d'une gestion rigoureuse.

Point d'alerte DRH. Le conseil médical, issu de la fusion des comités médicaux et commissions de réforme (décret n° 2022-350 du 11 mars 2022), intervient en formation restreinte pour les congés de longue maladie et de longue durée : octroi de la première période, passage au demi-traitement, dernière période, réintégration à l'issue des droits. Son avis éclaire la décision de l'autorité territoriale, qui n'est pas liée. Un contrôle médical s'exerce par médecin agréé (pour le congé de longue durée, au moins une fois par an après le passage au demi-traitement). Le refus de l'agent de s'y soumettre peut entraîner l'interruption du versement de sa rémunération.

Impact RH : Orange Urgence : Orange

Ce que le DRH doit faire lundi matin : saisir le conseil médical en formation restreinte aux étapes requises (octroi de la première période, passage au demi-traitement, dernière période, réintégration — décret n° 2022-350 du 11 mars 2022), organiser le contrôle médical par médecin agréé, et tirer les conséquences d'un éventuel refus de l'agent de s'y soumettre (interruption possible de la rémunération).

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5. Discipline, déontologie et responsabilité

Le congé d'office et les obligations de l'agent

Sources : décret n° 87-602 du 30 juillet 1987 ; obligations liées aux congés de maladie — le congé d'office et les obligations de l'agent en congé

Synthèse opérationnelle. Les congés de longue maladie et de longue durée, s'ils constituent des droits pour l'agent, comportent aussi des prérogatives pour l'employeur et des obligations à la charge de l'agent, qu'il importe de connaître. En premier lieu, le congé peut être accordé d'office. Lorsque l'autorité territoriale estime, au vu d'éléments médicaux et d'un rapport hiérarchique, que l'état de santé d'un agent le justifie, elle peut engager une procédure tendant à le placer d'office en congé de longue maladie ou de longue durée, notamment lorsque le comportement de l'agent, lié à son état de santé, compromet la bonne marche du service. Cette procédure, qui s'exerce sous le contrôle du conseil médical, doit être conduite avec les garanties appropriées. En second lieu, l'agent en congé est soumis à des obligations : se soumettre aux visites de contrôle, s'abstenir de toute activité incompatible avec son congé, et informer l'administration de sa situation. Le manquement à ces obligations, notamment le refus de contrôle ou l'exercice d'une activité incompatible, peut entraîner l'interruption de la rémunération, voire être sanctionné. La connaissance de ces règles est essentielle. Pour les collectivités, connaître la procédure du congé d'office, veiller au respect des obligations de l'agent, et en tirer les conséquences sont des éléments d'une gestion rigoureuse et sécurisée.

Point d'alerte DRH. Le congé de longue maladie ou de longue durée peut être accordé d'office : au vu d'éléments médicaux et d'un rapport hiérarchique, l'autorité peut engager une procédure de placement d'office, notamment quand le comportement de l'agent, lié à son état de santé, compromet la bonne marche du service, sous le contrôle du conseil médical et avec les garanties appropriées. L'agent en congé est soumis à des obligations : se soumettre aux visites de contrôle, s'abstenir de toute activité incompatible, informer l'administration. Le manquement (refus de contrôle, activité incompatible) peut entraîner l'interruption de la rémunération, voire être sanctionné.

Impact RH : Orange Urgence : Vert

Ce que le DRH doit faire lundi matin : connaître la procédure du congé de longue maladie ou de longue durée d'office (sur éléments médicaux et rapport hiérarchique, sous contrôle du conseil médical, avec garanties), et veiller au respect des obligations de l'agent en congé (visites de contrôle, abstention d'activité incompatible, information), dont le manquement peut entraîner l'interruption de la rémunération.

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6. Dialogue social et instances

La distinction du conseil médical et des instances de dialogue social

Sources : décret n° 2022-350 du 11 mars 2022 ; décret n° 2021-571 du 10 mai 2021 — la distinction des instances médicales et des instances de dialogue social

Synthèse opérationnelle. La gestion des congés de longue maladie et de longue durée fait intervenir une instance médicale, qu'il importe de ne pas confondre avec les instances de dialogue social, tout en appréhendant la dimension collective de l'absentéisme de longue durée. Il importe, en premier lieu, de distinguer clairement deux types d'instances. Le conseil médical est une instance médicale, consultée sur les situations individuelles de santé des agents, dont les congés de longue maladie et de longue durée ; il n'est pas une instance de dialogue social. Les instances de dialogue social, au premier rang desquelles le comité social territorial et sa formation spécialisée, ne connaissent pas des situations individuelles de santé, mais des questions collectives. Il importe, en second lieu, de souligner que l'absentéisme de longue durée, considéré non dans ses cas individuels mais dans sa dimension collective et statistique, constitue un sujet qui a toute sa place dans le dialogue social : son suivi, son analyse, et les politiques de prévention et de maintien dans l'emploi qui en découlent relèvent des attributions des instances de dialogue social, et sont documentés notamment par le rapport social unique. La bonne articulation de ces instances est essentielle. Pour les collectivités, distinguer le conseil médical des instances de dialogue social, et traiter l'absentéisme de longue durée dans sa dimension collective au sein du dialogue social, sont des éléments d'une gestion rigoureuse.

Point d'alerte DRH. Distinguer deux types d'instances. Le conseil médical (décret n° 2022-350) est une instance médicale, consultée sur les situations individuelles de santé, dont les congés de longue maladie et de longue durée ; ce n'est pas une instance de dialogue social. Le comité social territorial et sa formation spécialisée (décret n° 2021-571) ne connaissent pas des situations individuelles de santé, mais des questions collectives. L'absentéisme de longue durée, dans sa dimension collective et statistique, a toute sa place dans le dialogue social (suivi, analyse, politiques de prévention et de maintien dans l'emploi), et est documenté notamment par le rapport social unique.

Impact RH : Vert Urgence : Vert

Ce que le DRH doit faire lundi matin : distinguer le conseil médical (instance médicale, situations individuelles) des instances de dialogue social (comité social territorial, questions collectives), et traiter l'absentéisme de longue durée dans sa seule dimension collective et statistique au sein du dialogue social, en s'appuyant notamment sur le rapport social unique.

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7. Recrutement, attractivité et compétences

Le remplacement de l'agent absent et la continuité du service

Sources : article L. 332-13 du code général de la fonction publique ; pratiques de gestion — le remplacement des agents en congé de longue maladie ou de longue durée

Synthèse opérationnelle. Les congés de longue maladie et de longue durée, par leur durée potentiellement longue, posent la question du remplacement de l'agent et de la continuité du service, qu'il importe d'organiser. L'absence prolongée d'un agent, pour une durée pouvant atteindre plusieurs années, ne permet pas, dans la plupart des cas, de laisser le poste vacant ni de répartir durablement les missions sur les autres agents sans risque de désorganisation ou de surcharge. Il importe donc de pouvoir pourvoir au remplacement. À cette fin, la collectivité peut recruter un agent contractuel pour assurer le remplacement d'un fonctionnaire momentanément absent, notamment en congé de longue maladie ou de longue durée, sur le fondement des dispositions permettant le remplacement des agents absents. Ce recrutement, par nature temporaire, est conclu pour la durée de l'absence de l'agent remplacé. Il importe de gérer ce remplacement avec attention, en veillant à la transmission des dossiers et à l'intégration de l'agent remplaçant, et en préparant la réintégration du titulaire. La continuité du service et la préservation des compétences sont ainsi assurées. Pour les collectivités, organiser le remplacement des agents en congé de longue maladie ou de longue durée, en assurer la continuité, et préserver les compétences sont des éléments d'une gestion rigoureuse.

Point d'alerte DRH. L'absence prolongée (plusieurs années possibles) ne permet pas, le plus souvent, de laisser le poste vacant ni de répartir durablement les missions sans risque de désorganisation ou de surcharge. La collectivité peut recruter un agent contractuel pour remplacer un fonctionnaire momentanément absent, notamment en congé de longue maladie ou de longue durée, sur le fondement du remplacement des agents absents (article L. 332-13 du code général de la fonction publique), pour la durée de l'absence. Gérer ce remplacement avec attention : transmission des dossiers, intégration du remplaçant, préparation de la réintégration du titulaire.

Impact RH : Vert Urgence : Vert

Ce que le DRH doit faire lundi matin : organiser le remplacement des agents en congé de longue maladie ou de longue durée (recrutement d'un agent contractuel pour la durée de l'absence sur le fondement de l'article L. 332-13 du code général de la fonction publique), en veillant à la transmission des dossiers, à l'intégration du remplaçant et à la préparation de la réintégration du titulaire.

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8. Management public et organisation des services

La gestion de l'absence longue et la préparation du retour

Sources : articles L. 822-6 et suivants du code général de la fonction publique ; pratiques de gestion — l'accompagnement de l'absence de longue durée et du retour

Synthèse opérationnelle. La gestion d'une absence de longue durée ne se limite pas aux aspects administratifs du congé, mais suppose un accompagnement qu'il importe d'organiser, tant pendant l'absence qu'au moment du retour. Pendant l'absence, il importe, tout en respectant la situation de l'agent et sans immixtion dans sa vie privée ni dans son état de santé, de maintenir, lorsque l'agent le souhaite, un lien approprié avec la collectivité, afin d'éviter une rupture complète, qui rendrait le retour plus difficile. La préparation du retour est un moment déterminant. À l'approche de la fin du congé, ou lorsque l'agent manifeste le souhait de reprendre, il importe d'anticiper les conditions de la reprise, qui peut prendre plusieurs formes : une reprise à temps plein, une reprise dans le cadre d'un temps partiel pour raison thérapeutique, un aménagement du poste, ou, lorsque l'état de santé ne permet pas la reprise sur le poste, un reclassement. L'entretien de retour, et l'association de la médecine préventive, facilitent cette reprise. Un accompagnement attentif prévient la désinsertion professionnelle. Pour les collectivités, accompagner l'agent pendant l'absence de longue durée dans le respect de sa situation, préparer soigneusement son retour, et prévenir la désinsertion professionnelle sont des éléments d'une gestion rigoureuse et humaine.

Point d'alerte DRH. La gestion d'une absence longue ne se limite pas à l'administratif. Pendant l'absence, maintenir, si l'agent le souhaite et sans immixtion dans sa vie privée ni son état de santé, un lien approprié avec la collectivité, pour éviter une rupture qui compliquerait le retour. La préparation du retour est déterminante : anticiper les conditions de reprise, qui peut prendre plusieurs formes (temps plein, temps partiel pour raison thérapeutique, aménagement du poste, reclassement si la reprise sur le poste est impossible). L'entretien de retour et l'association de la médecine préventive facilitent la reprise et préviennent la désinsertion professionnelle.

Impact RH : Vert Urgence : Vert

Ce que le DRH doit faire lundi matin : accompagner l'agent pendant l'absence de longue durée (lien approprié s'il le souhaite, sans immixtion dans sa vie privée ni son état de santé) et préparer soigneusement son retour (anticipation des conditions de reprise : temps plein, temps partiel pour raison thérapeutique, aménagement du poste, reclassement ; entretien de retour, association de la médecine préventive).

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9. Finances locales avec impact RH

Le coût de l'absence de longue durée et l'assurance statutaire

Sources : articles L. 822-6 et suivants du code général de la fonction publique ; pratiques d'assurance statutaire — la dimension financière des congés de longue maladie et de longue durée

Synthèse opérationnelle. Les congés de longue maladie et de longue durée emportent une dimension financière significative pour la collectivité, qu'il importe d'appréhender et de couvrir. Le coût de ces congés résulte de plusieurs éléments. En premier lieu, la collectivité continue de verser le traitement de l'agent, à plein traitement pendant la première période, puis à demi-traitement, le supplément familial et l'indemnité de résidence étant par ailleurs maintenus intégralement. En second lieu, lorsque l'agent est remplacé, la rémunération de l'agent remplaçant s'ajoute, pour partie, à celle de l'agent absent, en particulier pendant la période de plein traitement. Il en résulte un coût qui peut être important, et qui pèse sur la section de fonctionnement. Pour couvrir ce risque, de nombreuses collectivités souscrivent une assurance statutaire, qui prend en charge, moyennant cotisation, tout ou partie des charges liées, notamment, aux congés de longue maladie et de longue durée. Il importe d'apprécier l'opportunité et l'étendue d'une telle couverture, au regard de la sinistralité de la collectivité. Pour les directions des ressources humaines et financières, appréhender le coût des congés de longue maladie et de longue durée, le suivre, et apprécier l'opportunité d'une assurance statutaire sont des éléments d'une gestion financière rigoureuse.

Point d'alerte DRH. Le coût de ces congés résulte du maintien du traitement (plein puis demi-traitement, supplément familial et indemnité de résidence maintenus intégralement) et, lorsque l'agent est remplacé, de la rémunération du remplaçant qui s'ajoute pour partie à celle de l'agent absent, surtout pendant le plein traitement. Ce coût, parfois important, pèse sur la section de fonctionnement. De nombreuses collectivités souscrivent une assurance statutaire couvrant, moyennant cotisation, tout ou partie de ces charges. Apprécier l'opportunité et l'étendue de cette couverture au regard de la sinistralité de la collectivité.

Impact RH : Vert Urgence : Vert

Ce que le DRH doit faire lundi matin : appréhender le coût des congés de longue maladie et de longue durée (maintien du traitement et des accessoires, coût du remplacement s'ajoutant pendant le plein traitement), le suivre, et apprécier avec la direction financière l'opportunité et l'étendue d'une assurance statutaire au regard de la sinistralité.

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10. Rapports publics, études et signaux faibles

Les issues du congé et la prévention de la désinsertion professionnelle

Sources : articles relatifs au reclassement et à la retraite pour invalidité ; analyses sur le maintien dans l'emploi — les issues des congés de longue maladie et de longue durée

Synthèse opérationnelle. Au-delà de leur régime, les congés de longue maladie et de longue durée posent la question de leur issue, qui révèle un enjeu de fond qu'il est éclairant de mettre en perspective : la prévention de la désinsertion professionnelle et le maintien dans l'emploi. À l'issue du congé, ou lorsque l'état de santé de l'agent évolue, plusieurs issues sont possibles. La première, la plus favorable, est la reprise des fonctions, le cas échéant progressive, dans le cadre d'un temps partiel pour raison thérapeutique, ou après aménagement du poste. La deuxième est le reclassement, lorsque l'agent est devenu inapte à ses fonctions mais apte à d'autres, dispositif qui a fait l'objet d'un renforcement avec la période de préparation au reclassement. La troisième, lorsque l'inaptitude est totale et définitive, est la retraite pour invalidité. Il importe de souligner l'enjeu de fond : la prévention de la désinsertion professionnelle, c'est-à-dire l'ensemble des actions visant à éviter qu'une absence de longue durée ne débouche inéluctablement sur une sortie de l'emploi. Cette préoccupation, de plus en plus présente, appelle une gestion active et anticipée des situations. Le signal de fond à suivre est cette exigence de maintien dans l'emploi. Pour les collectivités, connaître les issues des congés, privilégier le maintien dans l'emploi, et prévenir la désinsertion professionnelle sont des éléments d'une veille prospective.

Point d'alerte DRH. À l'issue du congé, ou lorsque l'état de santé évolue, plusieurs issues : la reprise des fonctions, le cas échéant progressive (temps partiel pour raison thérapeutique) ou après aménagement du poste ; le reclassement, lorsque l'agent est inapte à ses fonctions mais apte à d'autres, renforcé par la période de préparation au reclassement ; la retraite pour invalidité, en cas d'inaptitude totale et définitive. Enjeu de fond : la prévention de la désinsertion professionnelle, pour éviter qu'une absence longue ne débouche inéluctablement sur une sortie de l'emploi. Cette préoccupation appelle une gestion active et anticipée.

Impact RH : Vert Urgence : Vert

Ce que le DRH doit faire lundi matin : connaître les issues des congés de longue maladie et de longue durée (reprise, le cas échéant en temps partiel pour raison thérapeutique ou après aménagement ; reclassement avec période de préparation au reclassement ; retraite pour invalidité), et privilégier une gestion active et anticipée du maintien dans l'emploi pour prévenir la désinsertion professionnelle.

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Bilan du jour

Nombre total d'informations traitées

11 informations analysées et retenues sur les 10 rubriques de veille, consacrées au congé de longue maladie et au congé de longue durée dans la fonction publique territoriale, à partir de sources officielles (articles L. 822-6 à L. 822-17 du code général de la fonction publique, décret n° 87-602 du 30 juillet 1987, arrêté du 14 mars 1986, décret n° 2022-350 du 11 mars 2022) et des analyses spécialisées, sous l'angle du dispositif et de la procédure.

Les 5 informations les plus importantes du jour
  • Le congé de longue maladie : trois ans, dont un an à plein traitement puis deux ans à demi-traitement (articles L. 822-6 et suivants du code général de la fonction publique).
  • Le congé de longue durée : cinq ans pour cinq groupes d'affections, dont trois ans à plein traitement.
  • Le droit d'option irrévocable : entre congé de longue durée et maintien en longue maladie à demi-traitement.
  • Le conseil médical : saisi aux étapes clés, avec contrôle médical par médecin agréé.
  • Les issues : reprise, temps partiel thérapeutique, reclassement, ou retraite pour invalidité.
Alertes rouges à traiter en priorité
  • Droit d'option longue maladie / longue durée : informer l'agent du caractère irrévocable de son choix à l'issue de la première année de congé de longue maladie.
  • Saisine du conseil médical : saisir l'instance aux étapes requises, sous peine d'irrégularité.
  • Licenciement pour insuffisance professionnelle : distinguer rigoureusement l'insuffisance de la faute et de l'inaptitude physique.
  • Élections professionnelles : préparer le renouvellement des instances au scrutin du 10 décembre 2026.
  • Autorisations spéciales d'absence : anticiper la mise en conformité avant le 1er janvier 2027 (décret n° 2026-604).
Actions recommandées dans les 7 jours
  • Vérifier la correcte application des durées et du traitement pour les agents en congé de longue maladie ou de longue durée.
  • S'assurer de la saisine du conseil médical aux étapes requises et de l'organisation du contrôle médical.
  • Informer les agents concernés de leur droit d'option et de ses conséquences.
  • Organiser le remplacement des agents absents pour assurer la continuité du service.
  • Préparer la réintégration et le maintien dans l'emploi des agents dont le retour approche.
  • Apprécier la couverture par l'assurance statutaire au regard de la sinistralité.
Signal faible RH à surveiller

La prévention de la désinsertion professionnelle et le maintien dans l'emploi des agents à l'issue des congés de longue maladie et de longue durée, enjeu de fond d'une gestion active des absences de longue durée. Les congés de longue maladie et de longue durée, dont cette édition a détaillé le régime, posent, au-delà de leurs aspects techniques, la question déterminante de leur issue, qui révèle un enjeu de fond de plus en plus prégnant : la prévention de la désinsertion professionnelle et le maintien dans l'emploi. À l'issue de ces congés, ou lorsque l'état de santé de l'agent évolue, plusieurs issues sont en effet possibles : la reprise des fonctions, le cas échéant de manière progressive dans le cadre d'un temps partiel pour raison thérapeutique ou après un aménagement du poste de travail ; le reclassement, lorsque l'agent est devenu inapte à l'exercice de ses fonctions mais demeure apte à d'autres, dispositif renforcé ces dernières années par la période de préparation au reclassement ; ou, lorsque l'inaptitude est totale et définitive, la retraite pour invalidité. L'enjeu de fond, qui dépasse la seule gestion administrative des congés, réside précisément dans la capacité de la collectivité à prévenir la désinsertion professionnelle, c'est-à-dire à déployer l'ensemble des actions permettant d'éviter qu'une absence de longue durée ne débouche, de manière quasi inéluctable, sur une sortie définitive de l'emploi. Cette préoccupation, de plus en plus présente dans les politiques de ressources humaines, appelle une gestion active, précoce et anticipée des situations, loin d'un suivi purement passif. Le signal de fond à suivre est cette exigence croissante de maintien dans l'emploi.

Tableau de synthèse final

Rubrique Information Date Impact Urgence Action immédiate
Textes Le congé de longue maladie : trois ans 2026 ● Orange ● Orange Maîtriser le cadre
Textes Le congé de longue durée : cinq ans 2026 ● Orange ● Orange Distinguer du CLM
Jurisprudence Articulation des congés et droit d'option 2026 ● Orange ● Orange Informer du choix irrévocable
Rémunération Traitement, demi-traitement et droits maintenus 2026 ● Orange ● Vert Appliquer les règles de paie
Santé Conseil médical et contrôle médical 2022-2026 ● Orange ● Orange Saisir aux étapes requises
Discipline Congé d'office et obligations de l'agent 2026 ● Orange ● Vert Veiller aux obligations
Dialogue social Conseil médical et instances distinctes 2026 ● Vert ● Vert Distinguer les instances
Recrutement Remplacement et continuité du service 2026 ● Vert ● Vert Organiser le remplacement
Management Gestion de l'absence et préparation du retour 2026 ● Vert ● Vert Préparer le retour
Finances Coût de l'absence et assurance statutaire 2026 ● Vert ● Vert Apprécier la couverture
Rapports Issues du congé et désinsertion professionnelle 2026 ● Vert ● Vert Maintenir dans l'emploi
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Veille établie le samedi 17 octobre 2026 à partir de sources publiques officielles et de la presse professionnelle spécialisée. Les niveaux d'impact et d'urgence sont des appréciations opérationnelles destinées à hiérarchiser l'action des DRH, DGS et exécutifs locaux ; ils ne se substituent pas à une analyse juridique propre à chaque situation. Les liens renvoient directement aux sources de référence citées.

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